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酵母基因組DNA提取試劑盒使用注意事項(xiàng)
本試劑盒采用可以特異性結(jié)合 DNA 的離心吸附柱和*的緩沖液系統(tǒng),提取酵母基因組 DNA。離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料為本公司*新型材料,能夠高效專一吸附 DNA,可最大限度去除雜質(zhì)蛋白及細(xì)胞中其他有機(jī)化合物。提取的基因組 DNA 片段大,純度高,質(zhì)量穩(wěn)定可靠。使用本試劑盒提取的基因組 DNA 可用于各種常規(guī)操作,包括酶切、 PCR、文庫(kù)構(gòu)建、Southern 雜交等實(shí)驗(yàn)。
操作步驟:使用前請(qǐng)先在漂洗液中加入無(wú)水乙醇,加入體積請(qǐng)參照瓶體上的標(biāo)簽。所有離心步驟均為使用臺(tái)式離心機(jī)在室溫下離心。
1、取酵母細(xì)胞(不超過(guò) 5×107 ce l1 s),12000rpm 離心 1min,盡量吸除上清。
2、酵母細(xì)胞壁的破除:向酵母菌體中加入 470ul Buffer。充分懸浮菌體,加入 25ul 酵母破壁酶和 5ul 巰基還原劑,充分混勻。30℃處理 1-2h,期間可顛倒離心管混勻數(shù)次。
3、12000rpm 離心 lmin,棄上清,收集沉淀。
4、向沉淀中加入 200ul 溶液 A,充分懸浮沉淀,向懸浮液中加入 20ul 的 RNase A(10mg/ml),充分顛倒混勻,室溫放置 10min。
5、加入 20ul 的蛋白酶 K(10mg/ml),充分顛倒混勻。65℃水浴消化 15-30min,消化期間可顛倒離心管混勻數(shù)次,直至樣品消化*為止。
6、加入 200ul 溶液 B,再加入 200ul 無(wú)水乙醇,充分顛倒混勻,此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀,不影響 DNA 的提取,可將溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中,室溫放置 2min
注意事項(xiàng):
1、樣品應(yīng)避免反復(fù)凍融,否則會(huì)導(dǎo)致提取的 DNA 片段較小且提取量下降。
2、若試劑盒中的溶液出現(xiàn)沉淀,可在 65℃水浴中重新溶解后再使用,不影響提取效果。
3、如果實(shí)驗(yàn)中的離心步驟出現(xiàn)柱子堵塞的情況,可適當(dāng)延長(zhǎng)離心時(shí)間。
4、洗脫緩沖液的體積最好不少于 50ul,體積過(guò)小會(huì)影響回收效率;洗脫液的 pH 值對(duì)洗脫效率也有影響,若需要用水做洗脫液應(yīng)保證其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 將水的 pH 值調(diào)至此范圍), pH 值低于 7. 0 會(huì)降低洗脫效率。 DNA 產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃,以防 DNA 降解。
5、DNA 濃度及純度檢測(cè):得到的基因組 DNA 片段的大小與樣品保存時(shí)間、操作過(guò)程中的剪切力等因素有關(guān)?;厥盏玫降?DNA 片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度與純度。DNA 應(yīng)在 OD260 處有顯著吸收峰, OD260 值為 1.0 相當(dāng)于大約 50μg/ml 雙鏈 DNA、40μg/ml 單鏈 DNA。OD260/0D280 比值應(yīng)為 1.7-1.9,如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水,比值會(huì)偏低,因?yàn)?pH 值和離子存在會(huì)影響光吸收值,但并不表示純度低。
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